Как я понял, это какая-то часть упакованной программы, которая отрезается и хранится в другом месте. Только зачем это нужно, ведь протектор все равно должен добавить эти байты в exe файл чтобы запустить его.
Протектор их не довавляет в начало файла, а разбавляет украденные команды мусором и некоторые заменяет на свои. Это как-бы затрудняет распаковку и уберегает от сигнатурного поиска OEP.
