Нужно получить список dll загруженных в приложение x64. EnumProcessModules и Toolhelp32 не показывают. Пытался вытащить через PEB, но В структуре PPROCESS_BASIC_INFORMATION возвращаемой ZwQueryInformationProcess поле BaseAddress - 0. Думаю эти структуры для x86 и x64 разные. Если так, где можно достать структуры для x64
С х64 дело не имел, но мне кажется это ошибка в коде... Потому что для совместимости эти апишки должны работать так же как и в х86. Посмотри в отладчике сам что у тебя в пебе. И код покажи, другим проще будет тебе помочь.