DNA storage

Тема в разделе "WASM.HEAP", создана пользователем author2009, 2 июн 2009.

  1. author2009

    author2009 New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    11 май 2009
    Сообщения:
    310
    Привет всем. Недавно прочел такую теорию что для кодирования всех человвеческих признаков нужна маленькая часть ДНК, а все астальные ее части некоторые иследователи вообще называют мусором, и не могут понят зачем вообще они там нужны. После это следовала смелая теория о том что ДНК несет генетическую память рода. У меня воспрос к посетителям сайта как спеца м в области теории информации и железа. Какова емкость ДНК (в байтах)? Что вообще можно было там вообще закодировать? Какова избыточность даного хранилища. Только одна громадная просьба, вести себя прилично, тема ведь интересная.
     
  2. osrootd

    osrootd New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    30 июл 2008
    Сообщения:
    1.086
    Ну... там еще есть избыточный код, который нужен для проверки валидности исходного при копировании ДНК, когда клетка делится. CRC32 так же работает.)

    Теперь по поводу размеров.
    Давай так: точных данных нет. Для меня - одно пуриновое или пиримидиновое основание - это hex число, например, Цитозин кодируем как C9A8, а Гуанин как A8A8.
    A8 Указывает, что у этих соединений может возникнуть связь, в то время как Тимин (B1CC) никак с A8 не задружит.
    Интерес может представлять Урацил, который содержится в РНК. B2CC.
    Самое интересное происходит в рибосомах, где появляется такой фактор как энтропия. Можешь считать эту информацию избыточной.
     
  3. osrootd

    osrootd New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    30 июл 2008
    Сообщения:
    1.086
    А ты сабжем владеешь?
    Дай краткое понятие гена, и мы пойдем дальше
     
  4. Com[e]r

    Com[e]r Com[e]r

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    20 апр 2007
    Сообщения:
    2.624
    Адрес:
    ого..
    http://books.rusf.ru/unzip/add-on/xussr_gk/efremi01.htm?68/89
    листай до начала новой главы и читай, читай! )
     
  5. GoldFinch

    GoldFinch New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    29 мар 2008
    Сообщения:
    1.775
    приблизительно - смотриш в скольких различных равновероятных состояниях может находиться 1 элемент днк, береш от него логарифм по основанию 2, и умножаеш на число элементов - получаешь максимальное количество информации в битах.
     
  6. author2009

    author2009 New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    11 май 2009
    Сообщения:
    310
    Ген- носитель информации. Так будет нормально?
     
  7. osrootd

    osrootd New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    30 июл 2008
    Сообщения:
    1.086
    author2009
    Какой информации? О чем она? Это главное.
    Какую именно информацию хранит ген?
     
  8. author2009

    author2009 New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    11 май 2009
    Сообщения:
    310
    Как минимум ген хранитель информации о человеческих признаках (цвет волос/ форма волос/ **/**). Если уже развивать смелые теории о хранении памяти рода, то я сомневаюсь что она там хранится в виде мультимедийной информации (типа видео), скорее всего там нечто вроде указателей на динамическую память (которую редко затираю, или не затирают вообще). Тогда появляэться вопрос где этот внешний накопитель инфорации на который идут ссылки.
     
  9. Y_Mur

    Y_Mur Active Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    6 сен 2006
    Сообщения:
    2.494
    Маловато признаков перечислено - возьми любую программу архиватор и посмотри во сколько раз она ужимает осмысленную информацию. А тут дикая степень архивации - фактически тело человека или слона ужато до одной клетки :)) Конечно в теле много типовых повторяющихся структур, но и многоуровневая схема взимодействия этих структур тоже требует сохранения соответствующей информации, имхо тот кто утверждает, что в гене сохранено на порядки больше чем нужно просто совершенно не представляет какой объём инфы нужен для копирования человеческого тела :)
    А для родовой и т.п. памяти существуют другие способы передачи информации - например, всеобщее информационное поле куда она вся поступает и откуда в той или иной форме всегда доступна :)
     
  10. author2009

    author2009 New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    11 май 2009
    Сообщения:
    310
    Вполне логично. Единственный воспрос, есть в ДНК ссылки на него, или же сылки хранятся в другом месте?
     
  11. Y_Mur

    Y_Mur Active Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    6 сен 2006
    Сообщения:
    2.494
    author2009
    Имхо ДНК это инфа о железе (физическом теле), а программное обеспечение (душа, опыт прошлых жизней, родовая память и т.п.) полностью грузятся из сети (информационного поля). Сигнал о запуске в производство нового тела подают родители - для того у них и соответсвующий эмоциональный (биоэнергетический) всплеск во время процесса :)) А там уже его анализруют и программу для него подготавливают ;)
    Так что ссылка если есть, то косвенная - в смысле описано как создавать такое тело, которое способно подавать такой сигнал, во время определённого действия :))
     
  12. FatMoon

    FatMoon New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    28 ноя 2002
    Сообщения:
    954
    Адрес:
    Russia
    и тут эта муть... какая родовая память, мы с рождения учимся говорить, ходить, и не писать в постель. Все с нуля, все с нуля. Какие еще ссылки, мама дорогая :dntknw:
    (ушел за пивом, нервы лечить)
     
  13. asmlamo

    asmlamo Well-Known Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    18 май 2004
    Сообщения:
    1.742
    http://supotnitskiy.ru/index.htm

    Почитай про ретротранспонзоны.
     
  14. asmlamo

    asmlamo Well-Known Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    18 май 2004
    Сообщения:
    1.742
    >Какова емкость ДНК (в байтах)? Что вообще можно было там вообще закодировать?

    Длинна цепи ДНК человека около 3 млрд. нуклеотидных последовательностей.

    У каждой последовательности 4 варианта (АГЦТ) т.е. можно закодировать 2 битами.

    Итого емкость 750 мегабайт.

    Только что тебе это дает.
     
  15. asmlamo

    asmlamo Well-Known Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    18 май 2004
    Сообщения:
    1.742
    >Дай краткое понятие гена, и мы пойдем дальше

    Ген-структурная и функциональная единица наследственности, контролирующая развитие определенного признака или свойств
     
  16. asmlamo

    asmlamo Well-Known Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    18 май 2004
    Сообщения:
    1.742
    >Какую именно информацию хранит ген?

    В ДНК тысячи генов и каждый хранит свою группу информации.

    Цвет кожи,глаз размер члена :)
     
  17. asmlamo

    asmlamo Well-Known Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    18 май 2004
    Сообщения:
    1.742
    >Давай так: точных данных нет.

    Давай так ты нихрена в этом не понимаеш.


    >Для меня - одно пуриновое или пиримидиновое основание - это hex число, например,

    Хреновый из тебя прогер :) 4 варианта (АГЦТ) можно закодировать 2 битами а ты выделяеш аж целое hex число


    >интерес может представлять Урацил, который содержится в РНК


    При чем здесь РНК если мы ДНК обсуждаем.
     
  18. asmlamo

    asmlamo Well-Known Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    18 май 2004
    Сообщения:
    1.742
    Общая структура генома такова. Напомню, что размер генома человека 3200 Mb. Гены занимают всего 1200 Мb. Основная часть этого пространства приходится на псевдогены (нефункциональные гены, инактивированные мутациями), различные фрагменты генов и интроны. А на экзоны функциональных генов (суммарная длина зрелых РНК) приходится 48 Мb. Здесь есть некоторое лукавство, так как на одну пре-мРНК в среднем приходится 1,4 зрелых РНК. А из одной зрелой мРНК в некоторых случаях может получиться до тысячи белков. Межгенная ДНК занимает 2000 Мb, она представлена главным образом короткими рассеянными по всему геному повторяющимися последовательностями, которые занимают 1400 Мb. Один из таких повторов – Alu-повтор, длиной около 300 п.н., повторен в геноме миллион раз. Другой примечательный тип рассеянных повторов – длинные концевые повторы (LTR, long terminal repeat). Эти элементы являются молекулярными свидетельствами перескока фрагмента ДНК внутри генома. Общая протяженность таких участков на молекуле ДНК– 250 Мb.

    http://bio.fizteh.ru/student/files/biology/biolections/lection20.html?xsl:print=1
     
  19. author2009

    author2009 New Member

    Публикаций:
    0
    Регистрация:
    11 май 2009
    Сообщения:
    310
    Благодарю за обилие расчетов и линков. Что мне даст знание емкости ДНК в МБ? Пока это еще просто первый шаг в цепочке размышлений.