Кэрриэ Б. Криминалистический анализ файловых систем. Питер,2007г.480с.ISBN5469013111 Там про файловые системы и разделы на дисках.
Для начала детектим MBR (Если нет - вообще тривиально). Из нее ищем BPB дисков. Считаем все эти сектора-дорожки и обычно есть неразмеченные области. Видел многократно. Рекомендую загрузочный диск Paragon. То что надо для недецких извращений над дисками.